Ikastolako Batzarra kooperatibako organo gorena da. Urtean behin ikastolako kontuak onartzeaz gain, ildo estrategikoen jarraipena eta komunitatearen iradokizunak jasotzen dira bertan. 

Batzar Orokorraren ondoren, Errektore Kontseilua Ikastolako organo gorena da, bertan hartzen dira ikastetxeko funtzionamendurako erabaki garrantzitsuenak. Aldi berean, Kooperatiba gobernatu, kudeatu eta ordezkatzeko organoa da. Bere jarduera ondorengo batzorde desberdinetan banatzen da: ikasleekin harremanak, udalarekin harremanak, kontratazio batzordea, Hauspoa, bizikidetza, kirol taldea, mendi taldea, ekonomia, ingurumena, patioaren diseinua eta auzolana. Batzorde hauek banatuta lan egiten dute eta egindakoa Erretore Kontseiluan aurkezten dute hartutako erabakiak berretsiak izateko.

Ikastolan egin beharreko kontratazio berriak eta ordezkapenak aztertu eta irizpideak finkatzen dira batzorde honetan. Lan deialdiek eta lan poltsek bete beharreko baldintzak ere bertan erabakitzen dira. Errektore Kontseiluko bi guraso ordezkarik eta langile batzarreko bi langilek osatzen dute batzortea. Bertan zuzendariak aholkulari gisa parte hartzen du.

Eskola kirolaren eta ikastolako kirol jardueraren jarraipena egiten da bertatik. Egutegiak, antolaketa eta koordinazio orokorra burutzen dira 

Hauspoa elkartearen bileretara joan eta kultur ekitaldien antolaketa lanak koordinatzea izaten da ordezkaritza honen egitekoa.

Hiruhilabetean behin eta behar zehatzen arabera, Ikastolan

Beharren baitan, Ikastolan.

Bizikidetza, tutoretza eta berdintasun planaren sorkuntzan eta garapenean lan egin. Bizikidetza arauak aztertu, diagnostikoa egin eta hobetzeko neurriak hartu. Egunerokoan sortzen diren behar eta gatazkak kudeatu. Bizikidetza positiborako bidean ekintzak antolatu.

Hizkuntza normalkuntzarako plana garatu eta aurrera eramateko motor lanak egiten ditu Batzorde honek. Horretaz gain, Euskaren normalkuntzarako bidean lagungarri diren hainbat ekitaldi eta egitasmoaren antolaketa eta koordinazio lanak burutzen dira bertan.

Hiruhilero ikastolako egoera ekonomikoaren jarraipena egiten du batzorde honek.

Euskal Herriko Ikastolen Elkarteko Gipuzkoako Lurralde Batzarreko bileretan Ikastola ordezkatu eta bertako erabaki, eztaba, proposamen eta egitekoen berri Ikastolara ekartzea izaten da ordezkaritza honen egitekoa.